萍乡市武功山中等专业学校在处理学生违纪行为时，遵循公正、公平、教育的原则。学校会对违纪学生进行严肃处理，包括警告、记过、留校察看等，同时会根据违纪行为的性质和严重程度进行相应的处罚。学校也会给予违纪学生教育和引导的机会，帮助他们认识到错误的严重性并引导其改正错误。学校强调以教育为主，惩罚为辅，旨在让学生认识到自己的错误并改正，重新回到正确的成长道路上。