上饶市余干县现代职业学校对学生违纪行为的处理是非常严肃认真的。学校会根据违纪的程度和性质进行相应的处理，如口头警告、书面通报、暂时停课、纪律处分等。学校旨在引导学生意识到自己的错误，改正行为，并且确保学校的教育教学秩序得到维护。同时，学校也注重公正公平，保障学生的合法权益，处理过程透明公开，让学生和家长都了解并参与到处理过程中。