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安远应用职业技术学校的毕业证书与普通高中毕业证书在法律效力上并不完全相同。虽然职业技术学校颁发的证书可以证明学生在特定职业技能方面的学习成果，但与普通高中的毕业证书相比，其教育层次和涵盖有所不同。普通高中毕业证书更侧重于基础教育，具有更广泛的认可度。因此，两者在效力上存在差异。