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赣州市军科职业技术学校的助学金申请流程一般包括以下步骤：首先，学生需提交申请材料，包括家庭经济情况证明、成绩单等。其次，学校会审核材料，进行资格认定。最后，公示无异议后，学校将确定助学金发放名单。关于发放时间，一般是在每年的学期末或者开学初，具体以学校通知为准。如有需要，建议咨询学校相关部门负责人。